Metroid: Zero Mission, випущена для Game Boy Advance 2004 року, — це рімейк з нуля оригіналу 1986 року для NES, з якого почалася серія. Вона переосмислює перший спуск Samus Aran на планету Zebes за допомогою вдосконаленого рушія та дизайнерських принципів, закладених Metroid Fusion, надаючи примітивному оригіналу сучасного вигляду — деталізовані спрайти, повноцінну систему карт і плавне, чутке керування, якого версія для NES ніколи не мала.

Це більше, ніж прямий рімейк — вона розширює історію. Після знайомого полювання на Mother Brain гра продовжується цілком новим сегментом, де Samus, позбавлена своєї броні, мусить виживати скрадаючись, перш ніж повернути свою силу — по-справжньому напружений поворот, що переосмислює всю пригоду. Структура, керована дослідженням, якою славиться серія, тут представлена в найдоступнішій формі: перекриті зони, що відкриваються в міру здобуття нових здібностей, приховані покращення в кожному куточку й приємний цикл повернень назад із новими інструментами.

Розроблена Nintendo R&D1, вона широко вважається однією з найкращих ігор на GBA й ідеальною точкою входу в 2D Metroid. Вона поважає дизайн оригіналу, згладжуючи його шорсткості, і лишається чудовою портативною пригодою.