Metroid: Zero Mission, ra mắt cho Game Boy Advance năm 2004, là bản làm lại từ đầu của game NES gốc năm 1986 đã khởi đầu loạt game. Nó tái hình dung chuyến đi xuống đầu tiên của Samus Aran vào hành tinh Zebes bằng cỗ máy và tư duy thiết kế tinh tế được thiết lập bởi Metroid Fusion, khoác lên bản gốc thô sơ một lớp áo hiện đại — sprite chi tiết, một hệ thống bản đồ đàng hoàng, và cách điều khiển mượt mà, nhạy bén mà bản NES chưa từng có.

Hơn cả một bản làm lại thuần túy, nó mở rộng cốt truyện. Sau cuộc săn quen thuộc để đánh bại Mother Brain, trò chơi tiếp tục sang một phân đoạn hoàn toàn mới, nơi Samus, bị tước mất bộ giáp, phải sống sót bằng cách lén lút trước khi giành lại sức mạnh — một khúc ngoặt thực sự căng thẳng đặt lại toàn bộ cuộc phiêu lưu trong bối cảnh mới. Cấu trúc dựa trên khám phá mà loạt game nổi tiếng được thể hiện ở đây dưới dạng dễ tiếp cận nhất: những khu vực bị khóa mở ra khi bạn thu thập khả năng mới, những nâng cấp ẩn giấu ở mọi góc, và một vòng lặp thỏa mãn của việc quay lại những chỗ cũ với công cụ mới.

Do Nintendo R&D1 phát triển, nó được đông đảo xem là một trong những phần hay nhất trên GBA và là điểm khởi đầu lý tưởng cho Metroid 2D. Nó tôn trọng thiết kế của bản gốc đồng thời làm mượt những góc cạnh thô ráp, và vẫn là một cuộc phiêu lưu cầm tay tuyệt vời.