Metroid: Zero Mission, in 2004 uitgebracht voor de Game Boy Advance, is een van de grond af opgebouwde remake van het NES-origineel uit 1986 waarmee de serie begon. Het herbeeldt Samus Arans eerste afdaling in de planeet Zebes met behulp van de verfijnde engine en ontwerpgevoeligheden die door Metroid Fusion waren vastgelegd, en geeft het primitieve origineel een moderne verflaag — gedetailleerde sprites, een fatsoenlijk kaartsysteem, en de soepele, responsieve besturing die de NES-versie nooit had.

Meer dan een rechttoe rechtaan remake breidt het het verhaal uit. Na de vertrouwde jacht om Mother Brain te verslaan, gaat het spel verder in een geheel nieuw segment waarin Samus, ontdaan van haar pantser, sluipend moet zien te overleven voordat ze haar kracht heropeist — een oprecht spannende wending die het hele avontuur in een nieuw daglicht plaatst. De op verkenning gerichte structuur waar de serie beroemd om is, is hier in haar meest toegankelijke vorm aanwezig: afgesloten gebieden die opengaan naarmate je nieuwe vermogens verzamelt, verborgen upgrades in elke hoek weggestopt, en een bevredigende cyclus van terugkeren met nieuw gereedschap.

Ontwikkeld door Nintendo R&D1 wordt het algemeen beschouwd als een van de beste titels op de GBA en een ideaal beginpunt voor 2D-Metroid. Het respecteert het ontwerp van het origineel en schuurt tegelijk de ruwe randjes weg, en het blijft een uitstekend draagbaar avontuur.